Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms