Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFTA3P0C7M3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms