Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXB7P09629 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB7P09629 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms