Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms