Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD4P09016 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD4P09016 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms