Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CLDN9O95484 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN9O95484 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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