Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAMP4O75379 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms