Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PITX3O75364 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms