Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTIFO43310 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTIFO43310 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTIFO43310 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTIFO43310 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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