Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA3EO15041 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA3EO15041 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms