Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT87PA6NCN2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms