Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LAPTM4AQ15012 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LAPTM4AQ15012 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LAPTM4AQ15012 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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