Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRNQ16849 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPRNQ16849 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRNQ16849 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRNQ16849 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRNQ16849 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PTPRNQ16849 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PTPRNQ16849 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PTPRNQ16849 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRNQ16849 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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