Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD1Q16676 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXD1Q16676 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXD1Q16676 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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