Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KCNMA1Q12791 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
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KCNMA1Q12791 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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KCNMA1Q12791 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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