Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
MKRN3Q13064 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
MKRN3Q13064 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
MKRN3Q13064 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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