Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
E2F4Q16254 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
E2F4Q16254 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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