Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC1.71□□□□□ -2.13
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
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