Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GRIK4Q16099 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms