Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
MKRN3Q13064 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
MKRN3Q13064 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
MKRN3Q13064 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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