Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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FOXC1Q12948 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
FOXC1Q12948 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
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