Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIAQ12857 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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