Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FOXD1Q16676 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXD1Q16676 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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