Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZNF239Q16600 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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