Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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