Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SEC23AQ15436 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23AQ15436 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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