Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
NFIAQ12857 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NFIAQ12857 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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