Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CAPN6Q9Y6Q1 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CAPN6Q9Y6Q1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CAPN6Q9Y6Q1 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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