Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B3Q15393 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B3Q15393 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B3Q15393 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B3Q15393 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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