Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN4PQ13434 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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