Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MAP3K4Q9Y6R4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MAP3K4Q9Y6R4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms