Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFGEF1Q9Y6D6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms