Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PKP3Q9Y446 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PKP3Q9Y446 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms