Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POMPQ9Y244 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms