Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS5Q9UPZ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPS5Q9UPZ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms