Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FZD4Q9ULV1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FZD4Q9ULV1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms