Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms