Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COPS7AQ9UBW8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms