Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-18Q9QC07 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-18Q9QC07 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms