Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNRD1Q9P1U0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms