Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CWC25Q9NXE8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CWC25Q9NXE8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms