Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRN4Q9NRL3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRN4Q9NRL3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms