Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACKR4Q9NPB9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms