Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-5Q9HDB9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVK-5Q9HDB9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVK-5Q9HDB9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVK-5Q9HDB9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-5Q9HDB9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-5Q9HDB9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-5Q9HDB9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms