Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAT1LQ9HCJ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms