Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC86Q9H6F5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms