Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIFKQ9BYG3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms