Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KDM5DQ9BY66 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms