Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF4Q9BUZ4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms