Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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NDUFAF3Q9BU61 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NDUFAF3Q9BU61 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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